巧克力囊肿十年不治疗是有可能会恶变的，但恶变的几率会很低。巧克力囊肿又叫做子宫内膜异位囊肿，对患者卵巢的破坏较大，如果长期不进行治疗可能会影响到女性的生育能力，严重的还会导致巧克力囊肿增生、破裂等恶变情况发生。所以建议在早期发现有巧克力囊肿时，要积极治疗，可以选择药物治疗或者是手术切除治疗，以免发生巧克力囊肿恶变的情况。
1、试管婴儿治疗：目前试管婴儿治疗是针对巧克力囊肿可以妊娠的主要方法。
2、药物治疗：目前多采用GNRHa治疗，这种方法不建议直接用，多在试管婴儿的前期治疗，而且在试管前用2-6个月的话，可以增加试管婴儿的优质胚胎率、着床率，降低流产率。
3、手术治疗：手术切除盆腹腔表面的内异症病灶，可能会改善盆腔的毒性环境，但会导致卵巢储备不可逆的降低，术后一年妊娠率10%—30%，效率低。对无症状的3cm卵巢巧克力囊肿可以不必手术治疗。
任何一个有巧克力囊肿的患者，基本上在现实生活当中，对于这种疾病还是非常好奇的，其实当你听到自己是巧克力囊肿的患者的时候，可能大家一开始觉得这个名字还是比较好听，但是这样的一个名字绝对是中看不中用，因为这些囊肿里面似乎充满了黑乎乎的类似于巧克力一样的东西。所以说大家在平常的时候可能也在思考，巧克力卵巢囊肿会自己消失吗？
巧克力卵巢囊肿会自己消失吗？
患者如果有巧克力卵巢囊肿的话，那么在平常的时候大家最好能够看一下整个巧克力卵巢囊肿的情况，当然在月经激素的波动之下，可能整个卵巢上的内膜也会长大一些，慢慢的他们这些卵巢内膜就会生出各种不同的形态，比如就会出现巧克力囊肿，因为这些巧克力囊肿本身就是定居在卵巢里面的，所以他们根本就没有打算离开卵巢这样的一个地方，产生的血液也会越来越多。
如果你想知道巧克力卵巢囊肿会自己消失吗？有一种情况就是如果比较小的巧克力卵巢囊肿，他们可能会在口服避孕药之后自行萎缩，因为避孕药里面含有高效的孕激素，一直以来它都是抑制子宫内膜生长的一个关键性的因素，另外一种情况就是有可能巧克力囊肿破裂了，如果是这种情况的话，整个盆腔当中会有更多的积血，压力过高可能也都会出现其他情况，如果是这种情况的话，要切除巧克力卵巢囊肿。
巧克力卵巢囊肿怎么办？
其实如果患者有巧克力卵巢囊肿的话，那么建议每一个患者最好能够结合自己的实际情况到临床上去做相关的治疗，举个简单的例子来说，当患者是巧克力卵巢囊肿患者的时候，大家千万不要随便的判断，不要自己妄下结论，临床上在这样的一种疾病的治疗上确实也有很好的治疗方法。大家在进行实际治疗的过程当中，可以多和医生进行沟通和交流，只有这样才能够给我们带来一系列的保障。
1、保守治疗，对于病例症状较轻、囊肿很小或病情已自动缓解的女性卵巢巧克力囊肿者，肿可以进行药物保守治疗，使其缩小至完全消失;另外，口服避孕药对于预防巧克力囊肿的复发有一定效果。
2、药物疗法，当女性在诊断出卵巢内患有混合性包块时，可根据具体病情进行一到两个疗程的保守治疗，之后再做B超复查，假如包块有缩小可不用手术治疗，假如包块没有改变或者有长大，就就需要考虑手术治疗了。
3、中医疗法，在中医中最常见的治疗卵巢巧克力囊肿的方法就是艾附囊肿贴，它主要是遵循治病求本的原则，以疏肝理气，扶正因本，活血化瘀，软坚散结，清热解毒为治疗思路。
4、手术疗法，当前使用最多的治疗女性卵巢巧克力囊肿的手术方法在临床上常见的就是宫腹腔镜联合技术，此种治愈率非常高，而且在治疗手术后容易恢复，对女性的伤害极小，恢复后女性便会有继续生育的能力。